小五郎のもとに殺人予告をほのめかした“季節外れのハロウィンパーティ”への招待状が届く。挑戦状と受け取った小五郎は早速、園子と２人だけで会場に向かう。新一の家にも同じ招待状が届いていた。

下校途中の歩美は雨ガッパの男と激突してしまう。その男は女性を刺し、逃げる途中の通り魔だった。歩美は顔を見なかったが、通り魔の持ち物と思われる数字の５に似たマークが手に残っていた。

５に似たマークは車のエンブレムだと判明。通り魔が落としたのは血のついた車のキーだった。警察の手配により、アリバイがなくマスターキーをなくした３台の車の持ち主が米花警察署に集まる。

コナンたちは小五郎と蘭に連れられ、鬼沢郷という小さな村に観光に来ていた。ここでは、半年ほど前から子供の幽霊を見たという噂が広まっていた。コナンたちは幽霊を確かめるために散歩に行くが…!?

鬼沢郷という集落へ来ていたコナンたちは、殺傷事件に遭遇。暴力団風の男・川治が重要参考人として警察に連行されていった。コナンは、以前に永倉の家が建っていた廃屋から、ある物を見つけ…!?

喫茶店ポアロのウエイトレス・梓から、客が店に忘れた携帯電話の持ち主捜しを頼まれた小五郎だが、持ち主は交通事故で死んでいた。しかも男の身元は不明で手掛かりは暗号を残した携帯電話だけ…!?

携帯電話の持ち主捜しを頼まれた小五郎。コナンは携帯に入っていた数字の暗号を解き、携帯を忘れた男は、わざと携帯を忘れ、電話をかけてきた男に携帯を渡そうとしていたのではと推理するが…!?

園子の誘いでバス釣り大会に参加することになったコナンと少年探偵団は、優勝候補の鮎川・鱒渕と知り合いになる。しかし、大会２日目に湖で殺人事件に遭遇。フリーライターの船木が殺されたのだ。

コナンは、光彦が湖上で拾ったあるものを見て、犯人と殺害方法にたどりつく。バス釣り大会で表彰される鱒渕と鮎川が壇上に上がると、コナンは園子を眠らせ推理ショーを始める。

自分を捨てた母親を捜してほしいという人気子役、絹川和輝の依頼で熱海を訪れたコナンたちは殺人事件に遭遇。和輝が母親を捜していることを知っていたライターの鴨下保比呂が絞殺されていたのだ。

犯人と思われる女性の写真には右の胸にホクロが映っていた。仲居の三枝朝香、別所登志子、草野美津には、胸にホクロはない。コナンはビデオのタイムカウンターから殺人のトリックを解明するが…!?

園子の父のいとこであり鈴木財閥の相談役、鈴木次郎吉が怪盗キッドに挑戦状を叩きつけた。どうやら次郎吉は何か怪盗キッドに恨みがあるらしい。なんと、メールで怪盗キッドから返事が届き…!?

蘭とコナンが買い物をしていると会社帰りの西村佐知子と出会う。彼女は以前、蘭が生徒手帳を落としたとき拾って届けてくれた女性だ。ところが翌日、蘭が殺人事件現場に遭遇。被害者は佐知子だった。

トロピカルマリンランドでデートをする佐藤刑事と高木刑事。そんな中、偶然にもコナンたちと会う。デートが台無しになり、うなだれていた高木刑事は思い切って彼女に指輪入りのバッグを渡すが…!?

マリンランドでのデートが麻薬取引捜査に一変してしまった。すでに時計も５時半を回っている中、ついにコナンたちは運び屋を発見。佐藤刑事は、麻薬密売人・矢倉を捕まえようと近づくが…!?

元太に誘われコナンたちはペットショップを訪れた。そこへ二宮という若い男性が現れ、閉まっていた店のシャッターを上げて中へ入る。後に続いて入るコナンたちはそこで男の遺体を発見する。

蘭に頼まれ帝丹高校の幽霊騒動をコナンたちが調査すると、中庭に突如として２年前に死んだ保坂英彰の机が現れる。しかも、机の上には恨みのメモが置いてあり、地面には机を運んだ人間の足跡がない。

蘭に頼まれ帝丹高校の幽霊騒動を調査していたコナンたち。幽霊騒ぎの犯人はまだ学校にいることが予想された。犯人を特定したコナンは麻酔銃で園子を眠らせると、犯人の使ったトリックを暴き出す。

市営団地の構内で老女の遺体が発見された。「市役所に連絡済み」の紙が貼られた冷蔵庫の下に片手を突っ込んだ姿勢のまま死んでいたのだ。傍らには砕けた鉢植えがひとつあった。

小五郎が依頼を受け、尾行していた人見松一郎が南里薫という女性を襲おうとして、逃げる途中、米花のホテルから墜落死。その同時刻、松一郎の双子の弟、竹彦も自宅で遺体となって発見された。

小五郎が尾行していた人見松一郎が、米花のホテルから墜落死した。その同時刻、松一郎の双子の弟、竹彦も自宅で何者かに殺害された。事件にはタニザキという男がからんでいると知ったコナンは…!?

防波堤釣りにきたコナンたちは、釣り船で白根桐子、金谷峯人、江尻太志の３人と知り合う。昼過ぎになって船を操縦する井田巌が迎えにきたとき、江尻の竿に当たりがあり、海の中に引き込まれる。

防波堤釣りにきたコナンたちは、３人の釣り客と知り合う。だが、そのうちのひとり、江尻が倒れてしまう。江尻の左手首に傷跡があり、服の袖口にノリのようなものがついていたと聞いたコナンは…!?

コナンと蘭は園子に連れられお菓子の家フェアへやってきた。目当てはお菓子の鉄人３人組がいる洋菓子店エクリール。午後の部に入ったとき、厨房で頭部を強打された店長の橋垣の遺体が発見される。

商店街の福引会場でデジカメを当てている男性がいた。米花中央病院の医師、大和田誠だ。翌日、コナンたちは福引のバイトをしている男性に聞くと、実は大和田が当たるように細工をしたのだと明かす。

人気ゲームソフト「ギャドリン２」の発売が迫る。 発売元のシャイニング社の社長の道場が最終チェックのため、「ギャドリン２」のディスクをゲーム機の中に入れる。するとそこに映っていたのは…!?

プロ野球チーム・ジャガーズの守護神、能勢利三とスポーツタレントの本山正治と対談することになった小五郎はコナンと蘭を連れて沖縄へ。しかし、ホテルへ向かう途中、刺殺された能勢を発見する。

沖縄でプロ野球選手の能勢が刺殺された。コナンはスポーツタレントの本山を疑うが、彼にはアリバイがあった。しかし、コナンは蘭の持っていた時刻表からついに本山のアリバイトリックを解く。

コナンたちは廃屋の庭に怪しい３人の人影を発見する。彼らは生物雑誌に載せる毒蜘蛛特集のための撮影をしていたのだ。しばらくして次に取材する教授の新野に電話をかけると、新野の悲鳴が…!?

天体観測にやってきた少年探偵団は、１年前に失踪した河埜麻雄から招待状をもらったという野之宮悦子、御上平八、二川肇と出会う。近くの丘へ星を見にいったコナンたちは白骨化した遺体を発見する。

コナンたちは、１年前に失踪した河埜の白骨化した遺体を発見する。近くにはダイイング・メッセージとなる６本のタバコが残されていた。その後、ペンションで出会った二川の遺体が発見される。

阿笠博士に連れられてキャンプにやってきたコナンたち。しかし、サングラスで顔を隠した男が蘭の眠るテントに侵入し、蘭を連れ去ってしまう。その頃、崖から転落した事故車が発見され…!?

阿笠博士とコナンたち少年探偵団は、倉敷・吉備路をめぐる歴史の勉強を兼ねた週末旅行に来ていた。倉敷川沿いに観光していると、川に流れている桃の形をしたケースを見つける。

コナンたち少年探偵団は、暗号に書かれた場所を探すうち、女性の他殺死体を発見。地面に残されたダイイング・メッセージからコナンは、犯人は被害者と一緒にいた４人の中のひとりと推理するが…!?

琴屋旅館へ静養にきたコナン、蘭、小五郎。すると恋愛小説家の明智恵理が取材の打ち合わせをしていた。しかしその夜、コナンたちは恵理の取材対象の柴崎明日香と安西絵麻の他殺死体を発見する。

コナンたちが静養にきた琴屋旅館でモデルの柴崎明日香と油絵画家の安西絵麻が殺された。２つの殺人は密室で行われたが、警察は謎を解くことはできない。テレビでソリ大会の模様を見たコナンは…!?

コナンが毛利探偵事務所へ行くと、平次と和葉が待っていた。２人はコナンたちを甲子園と宝塚、どちらへ誘うかでもめる。そこで小五郎が依頼されていた殺人事件の推理勝負で決着をつけることに。

コナンたちを甲子園か宝塚に連れて行くかで、平次と和葉は小五郎が依頼されていた事件の推理勝負をすることに。平次とコナンはダイイング・メッセージの意味をすぐに解いてしまうが…!?

平次に誘われ、甲子園に高校野球を見に来たコナンたち。試合が始まると座っていたコナンと平次の足下で携帯電話が鳴った。電話に出ると、男の声が楽しいゲームをしないかとささやきかける。